taller_datos_agrobd
Taller de visualización y análisis con R de datos abiertos de agrobiodiversidad
Responsables de impartir el taller: Alicia Mastretta Yanes (amastretta@conabio.gob.mx) y Alejandro Ponce Mendoza (aponce@conabio.gob.mx).
En este taller aprenderemos los principios básicos de manejo de datos abiertos con énfasis en los datos abiertos de agrobiodiversidad que mantiene la CONABIO. Utilizaremos estos datos para hacer análisis y visualizaciones reproducibles utilizando el software libre R (https://www.r-project.org).
Versión sitio web de las notas: https://conabio.github.io/taller_datos_agrobd/
Objetivo:
Dar a conocer los datos abiertos de agrobiodiversidad que mantiene la CONABIO y herramientas de software libre para analizarlos y visualizarlos de forma reproducible.
Dinámica general del taller:
El taller será teórico-práctico, pero con énfasis en la práctica. Se expondrá la gama de datos disponibles y el tipo de preguntas que pueden responderse con ellos, y los principales análisis y visualizaciones que permite hacer el software R. Posteriormente las personas participantes podrán elegir un tema para hacer un pequeño proyecto de visualización, mismo que se espera puedan concluir hacia la finalización del taller.
Prerrequisitos:
Conocimientos básicos pero sólidos de R (el curso no es una introducción a R) Traer su propia laptop con R y Rstudio (https://www.rstudio.com) instalados
Temario:
- Datos abiertos
- Datos de agrobiodiversidad en la CONABIO
- Consultas (queries) de datos desde R utilizando API
- Exploración de datos en R
- Visualización de datos en R
Bibliografía:
- Manifiesto de Ciencia Abierta y Colaborativa: https://ocsdnet.org/wp-content/uploads/2015/04/Manifesto-Infographic-Spanish-1.pdf
- Rmarkdown y otras hojas con las principales funciones: https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/
Código de Conducta en el curso:
https://github.com/CONABIO/TallerDatosAgrobd/blob/main/codigo_conducta.pdf
Índice de materiales
Día 1
Datos abiertos
Presentación “Ciencia abierta y datos abiertos” tomada de: CONABIO. Taller Datos abiertos de agrobiodiversidad. Proyecto GEF Agrobiodiversidad Mexicana. CONABIO, México, 2021.
Datos de agrobiodiversidad en la CONABIO
Notas “Datos de Agrobiodiversidad en la CONABIO”
Consultas (queries) de datos desde R utilizando la API de Zendro
Notas “Introducción a GraphQL y consultas a la API”
Notas de Rmarkdown “Bajar datos maices desde la API de Graphql”
Script Rmarkdown “Bajar datos maices desde la API de Graphql”
Día 2
- Exploración de datos en R
Código de R para el manejo y visualización de Datos
- Visualización de datos en R